云南農(nóng)業(yè)大學發(fā)布茶葉多組學綜合數(shù)據(jù)庫

來源:科技日報 2023-08-08 09:59 http://www.iosapp77.com/

　　記者7日從云南農(nóng)業(yè)大學獲悉，該校盛軍教授團隊近期成功發(fā)布茶葉多組學綜合數(shù)據(jù)庫，為山茶屬遺傳育種提供了重要的數(shù)據(jù)支撐和檢索分析平臺。植物科學領(lǐng)域期刊《植物通訊》發(fā)表了相關(guān)研究成果。

　　茶被世界衛(wèi)生組織推薦為六大健康飲料之首，全世界有超過20億人飲茶。近年來，隨著基因組學技術(shù)廣泛應用，山茶屬多組學數(shù)據(jù)迅猛增長，為茶葉生物學研究帶來新機遇和多組學數(shù)據(jù)整合和利用的新挑戰(zhàn)，建立一個綜合性數(shù)據(jù)庫支持茶葉基因研究勢在必行。盛軍團隊長期致力于茶葉基因組、功效成分及功能機理研究，搜集并整合了山茶屬多個參考基因組、重測序、轉(zhuǎn)錄組等組學數(shù)據(jù)，并將這些數(shù)據(jù)整合為8個基礎(chǔ)模塊，共收集265個種以及714個品種的分類信息，可滿足人們對山茶屬生物資源信息的了解。

　　團隊中的云南農(nóng)業(yè)大學教授董揚、博士研究生李旭真還提供了包括泛基因組、臨滄茶樹重測序與土壤宏基因組測序數(shù)據(jù)三項獨立研究，構(gòu)建并發(fā)布了山茶屬多組學數(shù)據(jù)庫——Teabase。此外，盛軍團隊還開發(fā)了引物設(shè)計、基因組瀏覽器、基因表達查看等一系列實用分析工具，滿足研究學者對基因、變異位點、基因表達等信息的檢索、分析、整合以及下載等需求。

　　據(jù)悉，這是世界上首個綜合茶葉多組學數(shù)據(jù)庫，收錄了大量茶葉相關(guān)的多組學數(shù)據(jù)，一半以上數(shù)據(jù)為首次發(fā)表，包括12個參考基因組和一份泛基因組組裝、100份轉(zhuǎn)錄組，705份全球茶葉種質(zhì)資源的遺傳信息、1350份云南臨滄產(chǎn)區(qū)古樹茶重測序及對應的448份宏基因組測序數(shù)據(jù)，上億條變異數(shù)據(jù)，為茶葉基礎(chǔ)研究和遺傳育種提供了重要的數(shù)據(jù)和平臺支持，標志著我國茶葉基因組研究邁向新階段。（記者趙漢斌）

原標題：云南農(nóng)業(yè)大學發(fā)布茶葉多組學綜合數(shù)據(jù)庫

責任編輯：凌芹莉